丁实验室

教育

  • 2012 - 2013年的首席科学家,生物工艺开发集团,辉瑞制药,卡拉马祖,密歇根
  • 2010-2012博士后研究员,技术,帕萨迪纳加州理工学院
  • 2004-2010博士在药物化学,密歇根州,密歇根州安阿伯大学
  • 2001-2004 M.S.化学,内布拉斯加州,内布拉斯加州林肯大学
  • 1996-2000学士学位应用化学,北京大学,中国

传略

嵩鼎,博士,药物化学副教授,收到了他的学士学位在从北大应用化学。他追求他的M.S.大约在内布拉斯加DR的方向下的大学真菌次级代谢物的生物合成的研究。凉城杜。他进一步扩大了他的博士学位期间,他在天然产物领域的专业知识与博士培养。大卫·谢尔曼在密歇根大学。博士。丁则曾在博士博士后学者。弗朗西斯小时。阿诺德的实验室在技术加州理工学院。在阿诺德的实验室,他应用蛋白质工程和合成生物学的原则来制定的生物催化剂用于生产有价值的化学品,并了解除草剂代谢。他在发展药物分子长远利益促使他采取在辉瑞的位置。这个位置让他获得医药生物工艺开发经验,并相应地产生他各种类型的生物途径用于降低几种药物制造成本的生物催化剂。在2013年,博士。丁俊晖开始了他的位置在赌博网药物化学系助理教授。他的研究兴趣包括天然产物的生物合成,药物发现和开发,合成生物学,蛋白质工程,和化学生物学。

研究兴趣

丁实验室的一个主要目标是发现和开发小分子和生物制剂作为解决显著未被满足的医疗需求,如药物的肥胖,心血管疾病,癌症和传染性疾病新的治疗线索。大自然提供了一个广阔的小分子阵列已经激发了许多上市药品的开发,不断成为新的药物先导一位多产的来源。丁实验室是解密和使用这些小分子的生物合成逻辑用于药物发现特别感兴趣。在实验室中采用的一个策略涉及鉴定和微生物基因组数据,异源生产编码的化学品,结构确定,和生物活性的评价天然产物的生物合成系统的分析。通过设计新的生产工艺路线,开发能力的主机,并创造新的/改进的生物催化剂,叮叮实验室将优化化学生产力和筛选候选人的分散投资结构。在另一个研究领域,叮叮实验室致力于发展不同类型的酶的生物催化剂,在天然产物的生物合成途径,并采用他们生产的增值化学品。研究人员在实验室鼎赢得广泛的培训横跨有机化学,药物化学,生物化学,微生物学,分子生物学,细胞生物学,蛋白质工程,合成生物学,生物过程和发展。

小组成员

Group photo 的 Ding's lab members

当前:

  • 培兰张(学士学位制药,四川大学)
  • manyun辰(M.S.药物科学,南加州大学)
  • 岳刘(在药物化学B.S.,中国药科大学)
  • 阁楼米。鲁宾(生物化学B.S.,的密歇根大学)
  • 萨拉·希尔顿(本科)
  • 郭昕(本科)
  • zacharry RAAD(本科)
  • 马尔·帕特尔(本科,新兴学者)
  • leeann latford(本科)
  • alivia ishee(本科)

赌博网:

高中学生:

  • 朱利叶斯·柴
  • padmavathi雷迪
  • 凯瑟琳wulber
  • 莱恩辰
  • gahyun盟友利
  • 黄永忠

未毕业的学生:

  • 阳光明媚aroda
  • 哈里森Ĵ博尼利亚
  • 埃里卡克里斯滕森
  • 莫妮卡科扎德
  • 史蒂芬·克莱顿
  • 埃维莉娜德迪奇
  • nilay小号佛法
  • 韦斯利迪克森
  • 尼古拉斯·李
  • 金佰利劳德米尔克
  • 尼娜·约维奇
  • 米沙勒p梅塔
  • 迈克尔·帕特森
  • 麻秆鲍威尔
  • 阿尔伯特小芹
  • 凯尔voll和
  • 阿什利沃姆
  • 萨拉卡尼(惠顿学院)
  • 贾达布鲁克斯(白求恩-库克曼大学)
  • 阿丽亚娜即圣地亚哥(REU,波多黎各大学)
  • 德斯坦荷兰
  • Olufunmilayo Daudu (Florida A&M U)
  • 凯特琳该隐(REU,VCU)
  • 克里斯·拉科夫斯基(欧洲区域办事处,巴克内尔大学)

医药。 d。学生们:

  • 陈晓斌
  • 朱利安·拉希德
  • 约书亚升麦克布莱德
  • jaehyeok ROH
  • deniella下巴quee
  • 尼古拉斯·希勒
  • 斯蒂芬fotopoulos。

访问学者:

  • 红粉阳
  • 禺山
  • 江超
  • 塔里克·伊斯梅尔
  • 斯特凡schug

博士学生们:

  • 然佐(可能2018,博士后在UF)
  • 广江(AUG,2019年,在博士后UIUC)
  • 蛇杖(AUG,2019年,博士后普林斯顿)

博士后学者:

  • 广阳(2014 - 2017年)
 

佛罗里达隶属关系的大学

  • 中心对天然产品,药物发现和开发(cnpd3)
  • 新兴病原体研究所(EPI)
  • UF健康癌症中心
  • UF信息学研究所
  • UF生物多样性研究所
  • 国家高磁场实验室(NHMFL)

丁实验室出版物

  1. 利小时,张Y,王楼,唐兰瓦特,透明MC,李S,Reeves的瓦特, 丁ÿ,柄脚d,阳升。鸢尾素的分化和人类内脏白色脂肪细胞的褐变效果。 上午。学家译。水库。 2019,11:7410-7421。
  2. 左R, 丁ÿ。直接芳烃硝化系统nitrotryptophans的在合成 大肠杆菌. ACS SYN。生物学。 2019年,19,8:857-865。
  3. abouelhassan Y,张P, 丁Y, huigens RW。针对耐药性微生物的N-芳基化nh125类似物的快速杀灭的评估。 medchemcomm 2019年,10:712-716。
  4. gunasekera SP,迈尔JL, 丁Y, 阿布德KA,洛d,坎贝尔JE,angerh的er一个,古德塞尔JL,雷蒙LJ,刘俊,咋吨,luesch小时,teplitski米,保罗VJ。化学和珊瑚的致死黑色带疾病的宏基因组学研究中露出两颗广泛分布,氧化还原敏感的混合聚酮/肽大环。 学家NAT。刺。 2019,82:11​​1-121。
  5. 江克,张Y,鲍威尔毫米,希尔顿SM,培土NW,洛里亚R, 丁年。 混杂的细胞色素P450羟基化的芳族2,5-二酮哌嗪的脂族和芳族C-H键。 chembiochem。 2019,20:1068-1077。
  6. 江克,佐R,张Y,鲍威尔毫米,张P,希尔顿SM,洛里亚R,丁年。除草的thaxtomin的一锅合成biocombinatorial。 ACS CATAL。 2018年,8:10761-10768。
  7. 张Y,陈米,布鲁纳SD, 丁年。 异源生产的微生物的核糖体合成的和翻译后修饰的肽。 前微生物。 2018年,9:1801。 DOI:10.3389 / fmicb.2018.01801。
  8. 汉森一,amthorĴ,孙健,豪斯T,格雷戈里Ĵ,布鲁纳SD, 丁年。 重新设计硫胺素合成:前景和潜在的收益, 植物科学。 2018,273:92-99。
  9. 江克,张Y,鲍威尔毫米,张P,佐R,张Y,kallifidas d,小芹是,luesch小时,洛里亚R *,丁Y *。高产率生产在非致病性的除草的thaxtomin和类似物的 应变。 申请ENVIRON。微生物。 2018年,84 PII:aem.00164-18。 DOI:10.1128 / aem.00164-18。 (*:共同通讯作者)
  10. kallifidas d,江克, 丁ÿ,luesch小时。合理的工程 白色链霉菌 j1074为次级代谢产物基因簇的表达, 为MicroB。细胞的事实。 2018年,17时25分,DOI:10.1186 / s12934-018-0874-2。
  11. 张Y,李K,阳克,麦克布莱德JL,布鲁纳SD, 丁年。 一个分配肽环化酶处理单个多肽底物内的多个核心microviridin肽, NAT。 COMMUN。 2018年,9:1780,DOI:10.1038 / s41467-018-04154-3
  12. 阳克,科扎德米,荷兰d,张Y,luesch小时, 丁ÿ。光合生产防晒shinorine的使用的工程化的蓝细菌, ACS SYN。生物学。 2018年,7:664-671。
  13. 张Y,江克, 丁ÿ*,洛里亚R *。遗传背景影响致病岛功能和病原体出现在 , 摩尔。植物病理学。 2018年,19:1733年至1741年。 (*:共同通讯作者)
  14. 阳克,张Y,李NK,科扎德毫安,卡尼SE,luesch小时, 丁年。 蓝藻SFP型磷酸转移官能多样的生物合成途径的载体蛋白, SCI。代表。 2017年,7:11888. DOI:10.1038 / s41598-017-12244-3。
  15. 张P,李K,阳克,霞C,Polston先生JE,立克,李S,林Z,阳LJ,布鲁纳SD, 丁年。 从蘑菇细胞毒性蛋白 鸡腿菇 具有独特的模式聚糖结合和特异性, PROC。国家科。 ACAD。 SCI。 ü。秒。一个。 2017年,114:8980-8985。
  16. basak一个,abouelhassan Y,佐R,优素福小时, 丁Y, huigens RW。抗微生物肽启发nh125类似物:细菌和真菌生物膜根除剂和MRSA持留的快速杀手 有机BIOMOL。化学。 2017年,15:5503-5512。
  17. 佐R,张Y,姜C,克特JC,洛里亚R,布鲁纳SD, 丁年。 工程化的p450生物催化剂显示在芳烃硝化改进的活性和区域 - 滥交, SCI。代表。 2017年,7:842。DOI:10.1038 / s41598-017-00897-Z。
  18. 里K,condurso小时,李克, 丁ÿ,布鲁纳,SD。前体蛋白定向肽大环化在核糖体肽的生物合成途径, NAT。化学。生物学。 2016年,12:973-979。
  19. 张Y,比格内尔博士,佐R,风扇Q,HUGUET塔皮亚JC, 丁ÿ,洛里亚河混杂致病岛和致病系统发育 属。 摩尔。厂。微生物相互作用。 2016年,29:640-650。
  20. 张Y,谢C,旺小时,FOSS RM,克莱尔米,乔治EV,李S,卡茨一个,程小时, 丁ÿ,柄脚d,Reeves的WH,阳LJ。鸢尾素发挥褐变和人类白色脂肪细胞的脂肪形成双重影响。 上午。学家生理学。内分泌学。代谢。 2016年,311:e530-541。
  21. TU d,成X,高Y,阳P,丁Y,江℃。钯催化的吲哚的直接C-2的甲基化。 有机BIOMOL。化学。 2016年,14:7443-7446。
  22. 左R,驻军,basak一,张庆鹏,huigens RW * 丁ÿ*。 体外 对卤化喹啉类似物的抗真菌剂和抗生物膜活性 白色念珠菌新型隐球菌。 INT。学家antimicrob。代理商。 2016年,48:208-211。 (*:共同通讯作者)
  23. 乐Ĵ,高Y, 丁ÿ*,江C *。铜介导的C ^2吲哚通过C-H活化的自偶联-dehydrogenative由可移除的辅助 N - 嘧啶基团。 四面体通讯。 2016年,57,1728年至1731年(*:共同通讯作者)
  24. 佐R,张Y,HUGUET塔皮亚JC,梅塔米,德迪奇E,布鲁纳SD,洛里亚R, 丁ÿ。人工自给自足细胞色素P450直接硝酸盐氟化色氨酸类似物具有不同的区域选择性。 生物技术。学家 2016扬7. DOI:10.1002 / biot.201500416。
  25. 张Y,洛里亚R, 丁ÿ。从土壤中的微生物天然产物的应用。 土壤生态系统服务DOI:10.2136 / 2015.soilecosystemsservices.2015.0023
  26. 谢C,张Y,TRAN TD,旺小时,李S,乔治EV,庄小时,张P,康德尔一个,赖Y,柄脚d,Reeves的WH,程小时, 丁ÿ*,杨LJ *。鸢尾素控制生长,细胞内Ca2+ 信号,并且在成心肌细胞线粒体产热。 公共科学图书馆一个 2015年,10:e0136816。 (*:共同通讯作者)
  27. 阳克, 丁ÿ。最近在生物催化剂的发现,发展及其应用的发展。 生物有机。 MED值。化学。 2014年,22:5604-5612。

之前独立生涯选择出版物

  1. 丁ÿ拉特厘米,bolduc KL,哈坎森K,谢尔曼DH。通过酯合成酶化学的cryptophycin抗癌剂的键形成的非核糖体肽合成酶的模块。 学家上午。化学。 SOC。 2011,133:14492-14495。
  2. 丁ÿ,湿JR,cavalcoliĴ,李S,greshock TJ,米勒KA,finefield JM,sunderhaus JD,mcafoos TJ,冢本S,威廉斯RM,谢尔曼DH基因组为基础的两个异戊烯化的步骤在所述组件中的stephacidin的表征和notoamide抗癌在海洋药物 曲霉菌 学家上午。化学。 SOC。 2010,132:12733-12740。
  3. 丁ÿ,gruschow S,greshock TJ,finefieldĴ,谢尔曼DH,威廉姆斯RW。检测的vm55599和从预对郝青酰胺 日本曲霉青霉fellutanum:生物合成的影响。 学家NAT。刺。2008年,71:1574-1578
  4. 丁ÿ威廉姆斯RM,谢尔曼DH。隔离和从4 dimethylallyltryptophan合酶的表征 畸aurantiaca. 学家生物学。化学。 2008年,283:16068-16076
  5. 丁ÿ,seufert WH,贝克ZQ,谢尔曼DH。所述的cryptophycin P450环氧的分析揭示了底物耐受性和协同性. 学家上午。化学。 SOC。 2008年,130:5492-5498